Nejméně praktikované řešení, protože každý nemá k dispozici rozlehlý rybník s přítokem nebo extrémně vydatnou studnu. Zdrojem tepla je buď spodní voda, čerpaná ze studny do výměníku u tepelného čerpadla ( kapacitní zkouška studny 28 dnů s vydatností 180 L / 1hod / 1kW výkonu TČ ) , nebo je klasický plošný kolektor položen na dno rybníka, řeky nebo jiné vodní plochy a jako uzavřený okruh naplněn ekologickou nemrznoucí směsí.
Ideální řešení: na dno nového nebo vypuštěného rybníka, připevnění na stěny náhonu pro mlýn nebo vodní elektrárnu.
Nízké náklady na vybudování kolektoru do vodní plochy, vysoký provozní faktor
Při jímání spodní vody je nutná obrovská vydatnost zásobovací studny a jímací schopnost protější studny toto množství pohltit. V případě vodní plochy nutno zajistit její dostatečnou hloubku a rozlohu a trvalý přítok. Vždy se musí jednat o soukromé vlastnictví.